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Tests genéticos a través de NGS para pacientes con cáncer

¿Cuándo solicitar tests genéticos a través de NGS para pacientes con cáncer?

Noemí Rives PhD, Responsable de I+D+i de Bioarray , nos explica brevemente cómo la secuenciación masiva 🧬 permite seleccionar estrategias de tratamiento personalizados que ofrecen mejores expectativas de éxito. 

 

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Los ovocitos genéticamente anormales son más comunes de lo que pensábamos

Un estudio reciente publicado en American Journal of Human Genetics y realizado por un equipo de Washington State University ha demostrado que alrededor de 7% de los ovocitos tienen alteraciones en el número de cromosomas. Esto es debido a fallos en la recombinación durante el proceso de meiosis: aquél en el que el material genético materno y paterno se intercambia en los cromosomas antes de la división celular para producir ovocitos con la mitad del material genético.

“Se sabe desde hace mucho tiempo que la edad materna avanzada aumenta la probabilidad de ovocitos anormales, pero esta observación demuestra que muchos errores cromosómicos no tienen que ver con la edad materna”,  explica el profesor Terry Hassold, líder del equipo del estudio. “En cambio, son errores muy frecuentes en nuestra especie, por razones desconocidas.”

Como es de esperar, alteraciones cromosómicas en los ovocitos pueden dar lugar, tras su fecundación, a embriones desbalanceados cromosómicamente. Esto es algo que ahora se puede analizar gracias a algunas técnicas de reproducción asistida.

En este sentido, el PGT-A es un test que se utiliza para procedimientos de FIV, en el que el genoma del embrión se analiza mediante secuenciación NGS. Esto nos indica si cada embrión tiene o no alteraciones en su número de cromosomas (aneuploidías), para poder seleccionar los más viables y aumentar la probabilidad de implantación.

Bioarray fue pionera en la aplicación de NGS al PGT-A en 2014, y desde entonces proporcionamos el servicio de este análisis a centros de FIV europeos y sur americanos, con excelentes resultados clínicos.

Genética

XXVIII Congreso Nacional de la AEGH, Palma Mayo 2015

Durante los días 13, 14 y 15 de Mayo ha tenido lugar en Palma de Mallorca el XXVII Congreso de AEGH
(Sociedad Española de Genética Humana)

Durante el mismo hemos presentado , nuevos paneles de secuenciación masiva como son el nuevo
panel de paraparesias espástica hereditaria, que incluye un total de 35 genes, un panel de 63 genes relacionados
con la sordera congénita, así como dos nuevos paneles para cancer, uno de colon y pulmón y el otro con 50 oncogenes
que permite un seguimiento rápido en regiones «hotspot».

Por último, un panel para el diagnóstico genético de la Inmunodeficiencia severa combinada.

XXVII Congreso de AEGH

Aplicaciones en clínica de la secuenciación del exoma

Con el desarrollo de la tecnología al servicio de la salud, las aplicaciones en clínica de la secuenciación del exoma están permitiendo acceder a
valiosa información sobre la base molecular de ciertas patologías de origen genético, que hasta el momento, pasaba desapercibida en el
ámbito médico.

El exoma consiste en la fracción del genoma de un organismo compuesta por exones. Comprende por tanto, las fracciones codificantes que
constituirán el ARN mensajero maduro, que tras el proceso de traducción en la célula, formará las proteínas que desarrollarán sus funciones en el
organismo. Por ello, el estudio del exoma puede resultar de interés para el estudio de enfermedades complejas donde no hay un gen candidato
claro para estudiar, dado que se secuencian todos los genes.

Un ejemplo de su gran utilidad, la encontramos en dos de los estudios publicados en la revista Nature a principios de año. En ellos, se abordan
una serie de aspectos hasta el momento desconocidos, sobre mutaciones genéticas poco frecuentes, asociadas a la esquizofrenia. A través
de la secuenciación exónica, los investigadores demostraron que la enfermedad podría deberse a mutaciones raras que afectaban estructuras o
funciones de proteínas, frente a grandes alteraciones en unos pocos genes determinantes, que era la teoría que se estimaba hasta el momento.
Estos genes están involucrados en llevar a cabo funciones de conexión entre neuronas y la transmisión sináptica, y no solo eso, sino que
intervienen en procesos de aprendizaje, actividad neuronal, desarrollo de la memoria y plasticidad sináptica.

Con ello, la re- secuenciación del exoma permite llevar a cabo estudios personalizados de pacientes, consiguiendo una relación óptima entre
coste y eficiencia. En casos en los que una enfermedad estaba asociada a múltiples mutaciones y se optaba por la secuenciación Sanger
de genes individuales, este nuevo método permite detectar de forma sistemática alteraciones raras o poco frecuentes asociadas a patologías.
Dentro de este grupo, destacamos algunos ejemplos enfermedades para las que resulta un método especialmente útil, como la sordera
familiar, la esquizofrenia, retinopatías, procesos de discapacidad intelectual, el síndrome de Bardet-Biedl, retraso mental no sindrómico, autismo, etc.

En Bioarray ponemos a disposición de la comunidad médica nuestra plataforma para la secuenciación de exoma, así como las herramientas
bioinformáticas necesarias para la correcta interpretación de los datos obtenidos. Ofrecemos al ámbito clínico la posibilidad de acercar los
últimos avances en genómica personalizada, a clínicos y pacientes interesados en los nuevos métodos de investigación de enfermedades.

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