Microarray de expresión

Los microarrays de expresión son una herramienta muy últil para la determinación de los perfiles de expresión génica a un coste asequible. Trabajamos con las plataformas Agilent y Affymetrix, lo que nos permite una gran flexibilidad en los experimentos a realizar.

Gracias la plataforma Agilent y a nuestra experiencia en el diseño de arrays a medida,  podemos trabajar con cualquier organismo no modelo. Nosotros te diseñamos el array y nos encargamos de todo el experimento, desde el planteamiento del mismo hasta el análisis funcional.

Si lo necesitas, te asesoramos en todo momento sobre la mejor forma de realizar para obtener buenos resultados con un coste controlado. Por ejemplo, puedes trabajar utilizando dos flurocromos para minimizar el número de arrays (Agilent) o con la flexibilidad que te permite el trabajar con un solo color (Agilent, Affymetrix).

Nuestro servicio incluye:

• Diseño del microarray.
• Diseño del experimento.
• Anotación del genoma.
• Extracción de ARN total.
• Control de calidad y cuantificación.
• Marcaje, hibridación y escaneo.
• Análisis de calidad de los arrays procesados.
• Normalización.
• Cuantificación relativa de los genes con expresión diferencial con distintas herramientas estadísticas.
• Análisis funcional de los datos: Gene Ontology, KEGG, Biocarta, Reactome, etc.
• Depósito de datos en bases de datos.

Los datos se entregan en distintos formatos: PDFs, tablas y páginas webs con tablas dinámicas y gráficos. De esta forma la revisión de los mismos es mucho más fácil por parte del investigador.

En todo momento contarás con el asesoramiento de un equipo de bioinformáticos, que adaptarán el análisis a cada experimento particular. Trabajamos con los últimos pipelines y algoritmos, en la mayoría de ocasiones con herramientas de código abierto.